在多种血液蛋白质组检测技术中,除了传统的基于质谱的非靶向技术,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组技术——SomaScan技术和Olink技术正受到研究者的广泛青睐。这两种技术已帮助研究者获得了大量的数据和有用的信息,使得这对「蛋白检测双子星」在不断迭代中呈现出更为激烈的竞争。目前,SomaScan已更新至11K,而Olink也已更新至5K。研究者在选择这两种技术时可能会面临困惑。为帮助大家更好地了解这两大技术,本文汇总了近两年关于两平台比较的研究文章,包括检测稳定性与精确度、灵敏度、检测蛋白数量与范围等方面,供研究者参考。
第一篇研究
2023年,本文分析了48684位UK Biobank参与者的Olink蛋白质组学数据与35892名冰岛人群队列的SomaScan蛋白质组学数据,探讨了这些样本的蛋白质水平与基因型和表型信息的关联。此外,1514人同时接受了Olink Explore 3072和SomaScan 5K的检测,研究者对这两个平台的结果进行了详细分析和比较。结果显示,这两种常用的高通量蛋白质组学平台提供了有价值的信息,并揭示了它们之间的差异,某些情况下这些差异具有互补性。最终更新的结果表明,Olink的CV值显著高于SomaScan,而SomaScan的精确度则更高。链接:https://wwwnaturecom/articles/s41586-024-07549-z
第二篇研究
2025年,该研究比较了两种基于亲和力的蛋白质组学平台(Olink Explore 3072和SomaScan 11K)在4000名中国成年人中检测的2168种血浆蛋白质的性能。主要结论包括:(1)这两个平台测量的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),蛋白丰度和数据质量是影响相关性的关键因素。Olink平台上低于检测下限的样本比例较高,是导致相关性低的主要因素。(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink和SomaScan分别鉴定出765种和513种具有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs),其中400种蛋白的cis-pQTLs在两个平台间共定位。(3)Olink和SomaScan分别检测到1096种和1429种与体质指数(BMI)相关的蛋白。(4)Olink和SomaScan分别有279种和154种与缺血性心脏病(IHD)风险相关的蛋白。(5)在加入传统IHD风险因素后,Olink和SomaScan的ROC AUC值分别从0.845提高到0.862和0.863,这些结果展示了两种平台的实用性,并为未来研究的设计与解释提供了依据。链接:https://doiorg/101038/s41467-025-56935-2
第三篇研究
2024年,研究对Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中的102名患者的血浆进行了SomaScan 11K和Olink Explore HT(5400+蛋白)检测并进行了比较。主要结论:(1)Olink中有超过50%的蛋白低于一半样本的检测下限,未被检测到,而SomaScan的所有样本均高于检测下限,显示其灵敏度更高。(2)总体上,SomaScan的CV中值为68%,明显低于Olink HT的357%。SomaScan在产品迭代过程中保持良好的稳定性,而Olink在产品迭代过程中新增的蛋白导致其不稳定性增加。(3)在重复样本检测中,SomaScan的相关性中值为0.85,而Olink中值为0.65。(4)SomaScan的cis-pQTL绝对数量更多,约为2800,而Olink约为2100。(5)分析两个平台共有的超4400种蛋白的总体相关性,结果显示相关性中位值为0.14,其中约三分之一的蛋白具有良好至极好的跨平台相关性。整体来看,由于Olink平台检测下限的影响,相关性较差。链接:https://doiorg/101101/2024071124310161
第四篇研究
2025年,该研究利用7种蛋白质组学平台(SomaScan 11K、SomaScan 7K、Olink 5K、Olink 3K、质谱-高丰度蛋白去除法、质谱-纳米磁珠富集法和靶向质谱PRM检测)对78个个体的血浆进行了蛋白质组学检测和结果比较。主要结论:(1)七个技术平台共鉴定了13007个独特蛋白,其中SomaScan 11K和7K覆盖的蛋白质最多,分别为9645个和6401个。(2)SomaScan平台的CV值最低,是最准确和稳定的技术平台,Olink 5K的CV中值是Olink 3K CV中值的两倍多。(3)数据完整性评价显示,SomaScan平台的数据完整性最高,11K和7K分别为96.2%和95.8%。Olink 5K的数据完整性明显低于其先前3K版本,仅为35.9%。(4)检测蛋白的线性评价显示,97%的SomaScan平台的蛋白在线性范围内,而Olink 5K仅为42%。(5)SomaScan检测到了最多的FDA批准人血浆蛋白质生物标志物,覆盖了88%和76%。 Olink平台次之。链接:https://doiorg/101101/20250214638375
总而言之,以上四篇研究均涉及大样本量的SomaScan平台与Olink平台检测结果的比较。就总体检测蛋白数量及检测稳定性而言,SomaScan显示出更为优越的表现。因此,在血液大队列研究中,SomaScan平台无疑是一个卓越的选择!
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